Se localiza en:

El municipio de Santiago Juxtlahuaca se encuentra localizado en la zona noroeste del  estado formando parte de la región mixteca y del distrito de juxtlahuaca, del que también es sede  su cabecera municipal;limitada al norte  con el municipio de  San Sebastian  Tecomaxtlahuaca, con el municipio de San Miguel Tlacotepec, con el municipio de Santos Reyes Tepejillo  y con el municipio de San Juan Mixtepec al este con el municipio de San Martín Itunyosu y con el municipio de Putla Villa de Guerrero, al sur limitada  con el municipio de constancia del Rosario, que se encuentra dividido  en do exclaves separados y al oeste con el municipio de coicoyan  de las Flores;al suroeste limitada  con el estado de Guerrero, en particular con el municipio  de tlacoachistlahuaca y con el munición de  Xochistlahuaca.